目前全球流行的主要是HIV-1，根据编码包膜蛋白的env基因和编码壳蛋白的gag基因序列的同源性，HIV-1型又进一步分为3个组，M亚型组（main即主要组）、O亚型组（outline即外围组）和N亚型组（new，or non-M，non-O新组或非M非O组），其中M组有A，B，C，D，E，F，G，H，I，J，K11个亚型。此外，近年来发现多个流行重组型。O组是1990年从喀麦隆和加蓬分离到的，与M组其他亚型的氨基酸序列只有50%的同源性。N组是最近才从两名喀麦隆病人分离到的，在系统树上，既不属于M组，也不属于O组的一组新病毒，故称N组。
       HIV-2的生物学特性与HIV-1相似，但其传染性较低，引起的艾滋病临床进展较慢，症状较轻。HIV-2型至少有A，B，C，D，E，F,G7个亚型。
       我国以HIV-1为主要流行株，已发现的有A、B（欧美B）、B’（泰国B）、C、D、E、F和G8个亚型,还有不同流行重组型。1999年起在部分地区发现并证实我国有少数HIV-2型感染者。
       HIV分型总结如下表：        O亚型在最近几年通过向抗体检测初筛试剂和确认试剂中加入合成肽，HIV-1的O组可被检测出来，但其敏感性仍有待进一步的观察，因为HIV任何变异所造成的抗原结构细微改变都可能影响其敏感性。对于N组，由于比较罕见，并且发现的时间并不长，目前尚没有敏感性和特异性都很高的检测手段。因此，确实有检查不出来的情况。